Die Tradition der Protestanten in Lyon ist verzweigt und untrennbar mit dem Fortschritt der Stadt selbst. Im 16. Zeitalter erlebte Lyon eine Periode des Calvinismus, wobei etliche Händler und geistige Persönlichkeiten sich dem neuen Bekenntnis zuwandten. Diese erste Präsenz führte zu einer aktiven reformierten Versammlung, die jedoch auch bedeu